Die Linie S21 verkehrt planmäßig über die Verbindungsbahn zwischen Altona und dem Hamburger Hauptbahnhof. Der Bahnhof Hamburg-Altona wird aber von dieser Linie nicht angefahren weil die Züge nach dem Hp. Holstenstraße die Ausfädelung in Richtung Elbgaustraße-Pinneberg befahren.